Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NischQ80TM9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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