Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdp1Q7TSG2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms