Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Dsg1bQ7TSF1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Dsg1bQ7TSF1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1bQ7TSF1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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