Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ckap2lQ7TS74 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms