Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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