Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms