Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc6aQ78XR0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms