Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms