Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp8b3Q6UQ17 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Atp8b3Q6UQ17 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Atp8b3Q6UQ17 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Atp8b3Q6UQ17 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Atp8b3Q6UQ17 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Atp8b3Q6UQ17 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Atp8b3Q6UQ17 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b3Q6UQ17 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms