Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtifQ6PEE2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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