Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SvoplQ6PDF3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SvoplQ6PDF3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms