Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCY5

Gm2163, 4933409K07Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2163Q6PCY5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm2163Q6PCY5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2163Q6PCY5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms