Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbtb40Q6PCS8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbtb40Q6PCS8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbtb40Q6PCS8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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