Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc4Q6PAV2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms