Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp49Q6P9L4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp49Q6P9L4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp49Q6P9L4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Usp49Q6P9L4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp49Q6P9L4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp49Q6P9L4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp49Q6P9L4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp49Q6P9L4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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