Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mvb12bQ6KAU4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mvb12bQ6KAU4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mvb12bQ6KAU4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mvb12bQ6KAU4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mvb12bQ6KAU4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mvb12bQ6KAU4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mvb12bQ6KAU4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mvb12bQ6KAU4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mvb12bQ6KAU4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mvb12bQ6KAU4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms