Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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