Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CltbQ6IRU5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CltbQ6IRU5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms