Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rftn1Q6A0D4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms