Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Sbno1Q689Z5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sbno1Q689Z5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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