Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc18Q640L5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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