Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PatjQ63ZW7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PatjQ63ZW7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms