Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ift52Q62559 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ift52Q62559 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ift52Q62559 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ift52Q62559 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Ift52Q62559 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ift52Q62559 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ift52Q62559 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ift52Q62559 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ift52Q62559 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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