Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpd52Q62393 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms