Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SnrpcQ62241 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms