Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp1Q62209 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms