Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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