Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms