Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms