Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms