Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atf3Q60765 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atf3Q60765 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms