Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms