Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms