Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

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Length 764 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Satb1Q60611 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Satb1Q60611 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Satb1Q60611 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Satb1Q60611 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Satb1Q60611 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Satb1Q60611 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Satb1Q60611 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Satb1Q60611 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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