Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms