Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms