Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms