Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms