Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms