Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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