Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GpkowQ56A08 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms