Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms