Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg1lQ3V384 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Afg1lQ3V384 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms