Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk4Q3V129 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms