Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms