Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnpc3Q3UZ01 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnpc3Q3UZ01 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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