Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc114Q3UX62 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms