Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms