Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms