Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Znf48Q3US17 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf48Q3US17 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Znf48Q3US17 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Znf48Q3US17 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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